構造生物学3(情報生物学) で紹介したいくつかのサーバ:データベース
(1a) わが国発のライフサイエンスDB検索ページ
(1b) 医薬基盤研究所統合検索データベース http://sagace.nibio.go.jp/
(2) 米国NCBIのデータベース http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
このなかで特に汎用するもの Pubmed / Nucleic Acid / Protein / OMIM
(3) 相同性検索 : blast http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
(4) SwissProt / Uniprotと呼ばれる蛋白質配列サーバ http://www.uniprot.org/
(5) 蛋白質ドメインのDB二種類
SMART http://smart.embl-heidelberg.de/smart/set_mode.cgi?NORMAL=1
PFAM 英国sangerセンター http://pfam.sanger.ac.uk/
(6a) 変性領域予測サーバ disopred2 http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/disopred/
(6b) 変性領域とdomain予測サーバ globplot http://globplot.embl.de/
(6c) ヒト天然変性タンパク質DB IDEAL http://www.ideal.force.cs.is.nagoya-u.ac.jp/IDEAL/
(7) 立体構造データベース PDB
本家サイト http://www.pdb.org/
日本ブランチ http://www.pdbj.org/index_j.html
全世界統合 http://www.wwpdb.org/
PDBSUM わかりやすくまとまっている http://www.ebi.ac.uk/pdbsum/
(8) 配列からの立体構造予測 FORTE http://mbs.cbrc.jp/forte/query/main.do
(9) ヒトゲノム立体構造の網羅的モデリング SAHG http://bird.cbrc.jp/sahg/
(10) 配列から蛋白質の可溶性を予測 ESPRESSO http://mbs.cbrc.jp/ESPRESSO/TopPage.html